São Tomé era judeu da Galileia e como outros discípulos era um pescador. O primeiro encontro de Tomé com Jesus se deu nas margens do mar de Tiberíades, conforme relata o Evangelho de São João: “Estavam juntos Simão Pedro, Tomé chamado Gêmeo, e outros discípulos de Jesus”.
Simão Pedro disse: “Eu vou pescar”. Eles disseram: “Nós também vamos.” Saíram e entraram na barca. Mas naquela noite não pescaram nada. Quando amanheceu, Jesus estava na margem, mas os discípulos não sabia que era Jesus.
Então Jesus disse: “Rapazes, vocês têm alguma coisa para comer?” Eles responderam: “Não.” Então Jesus falou: “Joguem a rede do lado direito da barca e vocês acharão peixe.” (João 21, 2-3-4-5-6)
Ainda no Evangelho de São João, quando Jesus ouviu falar que Lázaro, irmão de Maria estava doente, disse aos discípulos: “Vamos outra vez à Judeia!” Os discípulos contestaram: “Mestre, agora há pouco os judeus queriam te apedrejar, e vais de novo para lá?”
Jesus disse: “O nosso amigo Lázaro adoeceu. Eu vou acordá-lo.” Os discípulos disseram: “Senhor, se ele está dormindo vai se salvar”. Então Jesus falou claramente para eles: “Lázaro está morto. Agora vamos para a casa dele.” Então Tomé, chamado Gêmeo, disse aos companheiros: “Vamos nós também para morrermos com ele”. (João 11, 7-8-11-12-14-16).
Em outro momento do Evangelho de São João, durante a ceia, após Jesus saber que foi traído por Judas e se retirar do meio dos apóstolos, Tomé disse a Jesus: “Senhor, nós não sabemos para onde vais como podemos conhecer o caminho?” Jesus respondeu; “Eu sou o Caminho, a Verdade e a Vida. Ninguém vai ao Pai senão por mim.” (João 14, 5-6).
“Nós vimos o Senhor”. Tomé disse: “Se eu não vir a marca dos pregos nas mãos de Jesus, se eu não colocar o meu dedo na marca dos pregos, e se eu não colocar a minha mão no lado dele, eu não acreditarei”.
Uma semana depois, os discípulos estavam reunidos de novo. Desta vez, Tomé estava com eles. Estando fechadas as portas, Jesus entrou. Ficou no meio deles e disse: “A Paz esteja com vocês.” Depois disse a Tomé: “Estenda aqui o seu dedo e veja as minhas mãos. Estenda a sua mão e toque o meu lado. Não seja incrédulo, mas tenha fé”.
Tomé respondeu a Jesus: “Meu Senhor e meu Deus!” Jesus disse: “Você acreditou porque viu? Felizes os que acreditam sem ter visto.” (João 20, 25-26-27-28-29). Esse ato, deu lugar à expressão segundo São Tomé: “ver para crer.”